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 核酸質譜介紹 

基質輔助激光(guāng)解吸電離飛(fēi)行時(shí)間質譜(MALDI-TOF MS)因日本島津公司的(de)田中耕一“開發了(le)用(yòng)于生物(wù)大(dà)分(fēn)子質譜分(fēn)析的(de)軟解吸電離方法”獲得(de)2002年諾貝爾化(huà)學獎而首次廣泛地走進公衆視野。

TOF的(de)原理(lǐ)是離子在電場(chǎng)作用(yòng)下(xià)加速飛(fēi)過飛(fēi)行管道,根據到達檢測器的(de)飛(fēi)行時(shí)間不同而被檢測即測定離子的(de)質荷比與離子的(de)飛(fēi)行時(shí)間成正比 ,檢測離子。MALDI-TOF-MS具有靈敏度高(gāo)、準确度高(gāo)及分(fēn)辨率高(gāo)等特點,爲生命科學等領域提供了(le)一種強有力的(de)分(fēn)析測試手段,并正扮演著(zhe)越來(lái)越重要的(de)作用(yòng)。

在臨床檢驗領域,MALDI-TOF MS主要用(yòng)于臨床微生物(wù)鑒定、基因分(fēn)型分(fēn)析、生物(wù)标志物(wù)鑒定、病原體鑒定、質譜成像等應用(yòng)的(de)發展,因爲其靈敏度高(gāo)、準确度高(gāo)及分(fēn)辨率高(gāo)等特點越來(lái)越被臨床檢測領域所青睐。在核酸檢測這(zhè)個(gè)細分(fēn)領域,MALDI-TOF MS技術用(yòng)于中等通(tōng)量定性和(hé)定量的(de)SNP及基因突變檢測,DNA甲基化(huà)的(de)定量檢測及CNV檢測等。

其獨特的(de)多(duō)重PCR技術,穩定準确的(de)結果,精準定量的(de)能力,經濟的(de)檢測成本,使核酸質譜在基因檢測領域具有極大(dà)的(de)競争力和(hé)廣闊的(de)應用(yòng)前景。随著(zhe)臨床實驗室對(duì)核酸質譜的(de)了(le)解和(hé)應用(yòng)不斷的(de)加深,未來(lái)該檢測平台或可(kě)成爲規範實驗室不可(kě)或缺的(de)标準裝備。

DNA甲基化(huà)介紹

甲基化(huà)與腫瘤

DNA甲基化(huà)(DNA methylation)是指在DNA甲基化(huà)轉移酶(DNMT)催化(huà)下(xià),以S-腺苷甲硫氨酸爲甲基供體,将活性甲基轉移至DNA鏈中特定堿基上的(de)化(huà)學修飾過程。哺乳動物(wù)基因組中,DNA甲基化(huà)多(duō)發生在CpG二核苷酸中的(de)胞嘧啶的(de)5位碳原子。DNA甲基化(huà)是一種表觀(epigenetic)修飾,它在不改變DNA序列的(de)情況下(xià),對(duì)個(gè)體的(de)生長(cháng)、發育、基因表達模式以及基因組的(de)穩定性起到重要的(de)調控作用(yòng),并且這(zhè)種修飾在發育和(hé)細胞增殖的(de)過程中是可(kě)以穩定傳遞的(de)。近年來(lái)的(de)大(dà)量研究表明(míng),DNA異常甲基化(huà)與腫瘤的(de)發生、發展、細胞癌變有著(zhe)密切的(de)聯系。

DNA甲基化(huà)作爲腫瘤生物(wù)标志物(wù)

DNA甲基化(huà)在腫瘤中的(de)作用(yòng)主要表現在以下(xià)幾個(gè)方面:一是甲基化(huà)的(de)CpG島二核苷酸中的(de)胞嘧啶以較高(gāo)的(de)頻(pín)率脫氨基變成胸腺嘧啶,造成基因突變;二是抑癌基因和(hé)DNA修複基因由于超甲基化(huà)而沉默;三是癌基因甲基化(huà)水(shuǐ)平降低而活化(huà);四是基因組總體甲基化(huà)水(shuǐ)平降低使轉座子、重複序列活化(huà)導緻染色體穩定性下(xià)降。這(zhè)些因素是導緻腫瘤發展、轉移、惡化(huà)最終導緻患者死亡的(de)重要原因。DNA總體甲基化(huà)水(shuǐ)平(即甲基化(huà)譜)和(hé)特定基因甲基化(huà)程度改變可(kě)作爲腫瘤診斷指标。

甲基化(huà)與腫瘤侵襲和(hé)轉移

DNA甲基化(huà)在腫瘤轉移過程中發揮著(zhe)重要作用(yòng),如有研究發現了(le)數個(gè)可(kě)以誘導EMT的(de)轉錄因子,在正常細胞中它們表現爲高(gāo)甲基化(huà)水(shuǐ)平因而其表達受到抑制,但在腫瘤細胞中它們的(de)甲基化(huà)水(shuǐ)平偏低而出現高(gāo)表達。利用(yòng)DNA甲基轉移酶(methyltransferase)抑制劑5-氮雜(zá)胞苷(5-aza-cytidine)處理(lǐ)MCF-7乳腺癌細胞,使其維持低甲基化(huà)狀态,結果顯示與EMT過程相關的(de)促細胞侵襲基因(pro-invasive EMT-associated gene)表達上調,細胞的(de)侵襲能力和(hé)轉移能力增強。此類研究結果值得(de)我們深思,采用(yòng)DNA甲基轉移酶抑制劑來(lái)治療腫瘤固然可(kě)能抑制原癌基因的(de)表達,但也(yě)可(kě)能造成腫瘤細胞轉移播散增加的(de)風險

甲基化(huà)與腫瘤治療

腫瘤預防和(hé)治療的(de)一個(gè)手段是通(tōng)過去甲基化(huà)恢複某些關鍵的(de)抑癌基因或DNA修複基因的(de)活性,目前研究最多(duō)的(de)是DNMTs抑制劑,它通(tōng)過抑制DNMT活性以逆轉異常的(de)DNA甲基化(huà)。第一個(gè)表型修飾藥物(wù)爲5-azacytidine及其類似物(wù)5-aza-2'-deoxycytidine(5-aza-CdR),這(zhè)類藥物(wù)已經美(měi)國FDA批準用(yòng)于白血病前骨髓增生異常綜合征的(de)治療。5-aza-CdR是胞嘧啶的(de)類似物(wù),在DNA複制過程中可(kě)以摻入到DNA鏈中,一方面它可(kě)以降低DNA接收甲基的(de)能力,另一方面它抑制DNMT活性,導緻DNA甲基化(huà)水(shuǐ)平的(de)降低。體外和(hé)體内試驗均表明(míng),5-aza-CdR具有降低超甲基化(huà)的(de)抑癌基因甲基化(huà)水(shuǐ)平從而抑制腫瘤的(de)能力,臨床表明(míng)應用(yòng)5-aza-CdR可(kě)提高(gāo)部分(fēn)IV期小細胞肺癌患者生存率,但該藥也(yě)存在著(zhe)不可(kě)忽視的(de)毒副作用(yòng)(如特異性不強,不能針對(duì)某一特定抑癌基因進行靶向治療;高(gāo)劑量的(de)5-aza-CdR可(kě)能誘發腫瘤的(de)轉移),因此其在臨床上的(de)應用(yòng)受到了(le)很大(dà)限制。也(yě)有研究表明(míng),低劑量的(de)As2O3可(kě)起到治療肝癌的(de)目的(de)。

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平台優勢介紹

1質譜是分(fēn)析領域檢測的(de)金标準,精準核酸質譜平台,可(kě)保證數據的(de)準确性

2物(wù)理(lǐ)參數通(tōng)過直接測定得(de)到,數據穩定,不會失真

3直接出結果,無需生信分(fēn)析,數據更容易解讀

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