DNA甲基化(huà)參與一系列重要生物(wù)學過程，包括早期胚胎發育、基因組印記、X 染色體失活、重複序列的(de)沉默以及許多(duō)人(rén)類疾病（如發育畸形、癌症、心血管疾病、糖尿病和(hé)神經心理(lǐ)失調等）過程中發揮重要作用(yòng)，DNA 甲基化(huà)也(yě)有助于闡明(míng)這(zhè)些重要的(de)生命過程背後隐藏的(de)奧秘。

DNA甲基化(huà)是表觀遺傳修飾的(de)主要方式，它是由DNA甲基轉移酶(DNA methyl-transferase，Dnmt)催化(huà)S-腺苷甲硫氨酸作爲甲基供體，将胞嘧啶轉變爲5-甲基胞嘧啶（mC）的(de)一種反應，它并不改變DNA的(de)一級結構，卻在細胞的(de)發育、基因的(de)表達、及基因組的(de)穩定性中起著(zhe)重要的(de)作用(yòng)。CpG島的(de)高(gāo)甲基化(huà)是腫瘤中存在的(de)普遍現象，而啓動子CpG島的(de)高(gāo)甲基化(huà)是除突變和(hé)缺失外腫瘤中抑癌基因失活的(de)第三種機制。因此，基因啓動子甲基化(huà)檢測在臨床診斷（如甲基化(huà)檢測與CT相結合）等方面具有很高(gāo)的(de)應用(yòng)價值。

目前甲基化(huà)分(fēn)析有很多(duō)方式，其中重亞硫酸鹽處理(lǐ)法最爲常見，基于此原理(lǐ)也(yě)存在不同分(fēn)析方法，而BSP和(hé)MSP是兩種不同的(de)甲基化(huà)分(fēn)析方法。

亞硫酸氫鹽修飾後測序法 (bisulfite sequencing PCR, BSP)：該方法是通(tōng)過對(duì)基因組DNA進行重亞硫酸鹽處理(lǐ)，非甲基化(huà)的(de)胞嘧啶被脫氨基而轉變成尿嘧啶，在随後的(de)PCR反應中尿嘧啶轉變成胸腺嘧啶，而甲基化(huà)的(de)胞嘧啶不能被脫氨基，在反應完成時(shí)被保留；然後在非甲基化(huà)區(qū)域設計引物(wù)進行PCR擴增，我們将擴增得(de)到的(de)PCR産物(wù)進行克隆測序，就可(kě)以分(fēn)析甲基化(huà)發生的(de)具體情況。

甲基化(huà)特異性的(de)PCR法 (methylation-specific PCR，MSP)：該方法是通(tōng)過對(duì)基因組DNA進行重亞硫酸鹽處理(lǐ)，然後在甲基化(huà)區(qū)域設計甲基化(huà)特異性的(de)引物(wù) (M Primer) 和(hé)非甲基化(huà)特異性的(de)引物(wù) (N Primer)，使用(yòng)M Primer和(hé)N Primer分(fēn)别進行PCR擴增，檢測此MSP擴增産物(wù)，如果使用(yòng)M Primer能擴增出片段，則說明(míng)該被檢測的(de)位點存在甲基化(huà)；若用(yòng)N Primer擴增出片段，則說明(míng)被檢測的(de)位點不存在甲基化(huà)。

兩種甲基化(huà)分(fēn)析方法的(de)區(qū)别